Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a9P28571 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a9P28571 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms