Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd9P28357 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd9P28357 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms