Protein–RNA interactions for Protein: P28301

Lox, Protein-lysine 6-oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LoxP28301 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LoxP28301 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LoxP28301 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LoxP28301 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LoxP28301 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LoxP28301 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LoxP28301 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms