Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja4P28235 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gja4P28235 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja4P28235 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gja4P28235 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja4P28235 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gja4P28235 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms