Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gjb1P28230 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gjb1P28230 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gjb1P28230 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms