Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-DMaP28078 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-DMaP28078 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms