Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd40lgP27548 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd40lgP27548 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms