Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ChgaP26339 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ChgaP26339 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgaP26339 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ChgaP26339 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms