Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gabra2P26048 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gabra2P26048 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms