Protein–RNA interactions for Protein: P25318

Col8a2, Collagen alpha-2(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a2P25318 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col8a2P25318 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Col8a2P25318 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms