Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
NdnP25233 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
NdnP25233 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
NdnP25233 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
NdnP25233 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NdnP25233 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NdnP25233 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NdnP25233 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
NdnP25233 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
NdnP25233 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms