Protein–RNA interactions for Protein: P23798

Pcgf2, Polycomb group RING finger protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf2P23798 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcgf2P23798 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pcgf2P23798 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms