Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Eif3aP23116 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Eif3aP23116 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms