Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RarbP22605 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RarbP22605 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RarbP22605 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RarbP22605 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RarbP22605 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RarbP22605 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RarbP22605 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RarbP22605 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RarbP22605 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RarbP22605 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RarbP22605 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RarbP22605 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RarbP22605 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RarbP22605 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RarbP22605 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RarbP22605 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RarbP22605 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RarbP22605 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RarbP22605 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RarbP22605 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RarbP22605 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RarbP22605 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RarbP22605 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RarbP22605 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RarbP22605 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RarbP22605 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RarbP22605 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RarbP22605 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RarbP22605 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RarbP22605 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RarbP22605 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RarbP22605 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RarbP22605 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RarbP22605 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RarbP22605 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RarbP22605 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RarbP22605 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RarbP22605 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RarbP22605 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RarbP22605 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RarbP22605 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms