Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SftpcP21841 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SftpcP21841 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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