Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Abcb1aP21447 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Abcb1aP21447 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms