Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fcer1aP20489 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fcer1aP20489 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms