Protein–RNA interactions for Protein: P20060

Hexb, Beta-hexosaminidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexbP20060 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HexbP20060 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HexbP20060 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HexbP20060 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HexbP20060 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HexbP20060 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HexbP20060 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HexbP20060 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HexbP20060 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HexbP20060 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HexbP20060 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HexbP20060 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HexbP20060 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HexbP20060 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HexbP20060 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HexbP20060 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HexbP20060 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HexbP20060 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HexbP20060 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HexbP20060 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HexbP20060 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HexbP20060 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms