Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnc1P19123 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnnc1P19123 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms