Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd48P18181 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd48P18181 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd48P18181 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms