Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tgfb3P17125 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgfb3P17125 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms