Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rag1P15919 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rag1P15919 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rag1P15919 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rag1P15919 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms