Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AppP12023 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AppP12023 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AppP12023 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AppP12023 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AppP12023 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AppP12023 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AppP12023 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AppP12023 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AppP12023 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AppP12023 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AppP12023 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AppP12023 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AppP12023 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AppP12023 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AppP12023 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms