Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Fv4P11370 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Fv4P11370 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms