Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
Tnp1P10856 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms