Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl3P10855 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccl3P10855 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl3P10855 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms