Protein–RNA interactions for Protein: P10605

Ctsb, Cathepsin B, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsbP10605 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CtsbP10605 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtsbP10605 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms