Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Amd1P0DMN7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Amd1P0DMN7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms