Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PtprqP0C5E4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprqP0C5E4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms