Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Csf3P09920 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms