Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LtaP09225 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LtaP09225 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LtaP09225 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtaP09225 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtaP09225 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtaP09225 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LtaP09225 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtaP09225 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtaP09225 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtaP09225 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LtaP09225 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LtaP09225 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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LtaP09225 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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LtaP09225 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LtaP09225 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LtaP09225 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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