Protein–RNA interactions for Protein: P08121

Col3a1, Collagen alpha-1(III) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col3a1P08121 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col3a1P08121 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col3a1P08121 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col3a1P08121 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms