Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ifna6P07350 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna6P07350 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms