Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxa4P06798 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxa4P06798 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxa4P06798 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms