Protein–RNA interactions for Protein: P01797

Ig heavy chain V-III region U61, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01797 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01797 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01797 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01797 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01797 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01797 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01797 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01797 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01797 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01797 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01797 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01797 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01797 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01797 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01797 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01797 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01797 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01797 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01797 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms