Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01669 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01669 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
P01669 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01669 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01669 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01669 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01669 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01669 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01669 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01669 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01669 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01669 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01669 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01669 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01669 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01669 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01669 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01669 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01669 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01669 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01669 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01669 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01669 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01669 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms