Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01664 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01664 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01664 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01664 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01664 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01664 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01664 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01664 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01664 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01664 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01664 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01664 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
P01664 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01664 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01664 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01664 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01664 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01664 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01664 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01664 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01664 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01664 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01664 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01664 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01664 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01664 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01664 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01664 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01664 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01664 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01664 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01664 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01664 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01664 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01664 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms