Protein–RNA interactions for Protein: P01663

Ig kappa chain V-III region PC 4050, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01663 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P01663 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01663 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01663 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01663 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01663 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01663 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01663 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01663 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01663 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01663 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01663 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01663 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01663 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P01663 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P01663 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms