Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01636 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01636 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01636 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01636 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01636 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01636 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01636 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01636 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01636 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01636 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01636 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01636 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01636 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01636 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01636 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01636 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01636 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01636 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01636 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01636 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01636 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01636 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01636 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01636 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01636 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01636 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01636 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01636 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01636 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01636 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
P01636 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01636 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01636 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms