Protein–RNA interactions for Protein: P01193

Pomc, Pro-opiomelanocortin, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PomcP01193 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PomcP01193 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PomcP01193 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PomcP01193 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PomcP01193 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PomcP01193 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PomcP01193 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PomcP01193 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PomcP01193 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PomcP01193 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PomcP01193 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PomcP01193 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PomcP01193 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms