Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Robo1O89026 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Robo1O89026 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Robo1O89026 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Robo1O89026 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Robo1O89026 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo1O89026 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Robo1O89026 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Robo1O89026 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo1O89026 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Robo1O89026 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Robo1O89026 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms