Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacng2O88602 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng2O88602 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms