Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd70O55237 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd70O55237 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd70O55237 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd70O55237 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Cd70O55237 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd70O55237 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cd70O55237 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms