Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cbx4O55187 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cbx4O55187 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms