Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PrxO55103 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PrxO55103 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrxO55103 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PrxO55103 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PrxO55103 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PrxO55103 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PrxO55103 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PrxO55103 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrxO55103 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrxO55103 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrxO55103 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrxO55103 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrxO55103 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrxO55103 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PrxO55103 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PrxO55103 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PrxO55103 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrxO55103 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrxO55103 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrxO55103 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PrxO55103 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrxO55103 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PrxO55103 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PrxO55103 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrxO55103 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrxO55103 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrxO55103 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrxO55103 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PrxO55103 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrxO55103 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrxO55103 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PrxO55103 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PrxO55103 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms