Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trappc3O55013 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Trappc3O55013 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms