Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarce1O54941 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarce1O54941 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms