Protein–RNA interactions for Protein: O54798

Brs3, Bombesin receptor subtype-3, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brs3O54798 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brs3O54798 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brs3O54798 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brs3O54798 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms