Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccr6O54689 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccr6O54689 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms