Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

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Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nek2O35942 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek2O35942 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nek2O35942 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek2O35942 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek2O35942 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek2O35942 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek2O35942 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nek2O35942 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek2O35942 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek2O35942 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek2O35942 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek2O35942 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nek2O35942 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms